Первая повесть "Жүрек қазынасы" ("Сокровище сердца") вышла в свет в 1962 г. Автор сборника новелл, рассказов и повестей "Самал" ("Ветерок", 1972), "Құс жолы" ("Млечный путь", 1975) и других, романов "Ескі дос" ("Старый друг", 1979), "Торғай толғауы" (1 кн., 1966; 2 кн., 1970), "Алғашқы қоңырау" ("Первый звонок", 1978), "Таза бұлақ" ("Чистый родник", 1984). Перевел на казахский язык рассказы русских писателей Л.Н.Толстого, И.Н.Бунина. Произведения Молдагалиева переведены на инностранные языки. Награжден золотой медалью им. А.А.Фадеева (1984).